云南网云南主导完成第一个植物基因组

 

  9月4日上午，云南完成首个《铁皮石斛基因精细图谱》科技成果新闻通气会在普洱市普洱茶研究院举行。也是云南省主导完成的第一个植物基因组。
  云南农业大学校长、普洱市副市长盛军介绍，铁皮石斛是云南省极具特色的珍稀高端药用、食用植物。2012年底，云南石斛种植面积超过6万亩，产值已达到30亿元。2012年1月，云南省成立了石斛产业技术创新战略联盟，并设立专项经费开展了云南铁皮石斛地理标志研究、质量标准研究、石斛科技产业发展规划以及铁皮石斛基因组计划等课题。
  作为联盟成员单位的云南农业大学联合普洱市普洱茶研究院，在中国科学院昆明动物研究所的技术支持下，以云南农业大学校长盛军、昆明动物研究所王文研究员为课题组组长，全面展开了云南铁皮石斛基因组计划的实施。在普洱茶研究院严亮博士和昆明动物研究所董扬博士（现为昆明理工大学生命科学与技术学院教授）、王筱硕士的全力协同工作下，使用目前最新的第二代测序技术和近期刚刚引入国内的第三代单分子测序技术，用一年半时间，完成了铁皮石斛全基因组测序工作，绘制了铁皮石斛的全基因精细图谱。采用最新的第三代单分子测序技术，在团队的功能努力下，使得铁皮石斛成为第一个进行全基因组测序的药食同用植物；同时，也是云南省主导完成的第一个植物基因组。铁皮石斛全基因组测序研究的材料来源于普洱市辖区内广泛种植的铁皮石斛品种。

 

 

  中国科学院昆明动物研究所研究员王文说，目前，测序深度已达铁皮石斛 基因组大小的200倍，测序结果已覆盖95%的全基因组和97%的基因编码区，超过国际上同行复杂基因测序的最高水平。研究组进一步解析了铁皮石斛基因组中的基因信息，发现了48200多个蛋白质编码基因，其基因数目是目前所有已经测序的植物中最多的，从基因水平证实了铁皮石斛基因组的复杂性。
  会上盛军说，铁皮石斛基因组精细图谱的绘制完成，标志着铁皮石斛研究进入基因时代，同时也开启了国际药食同用植物基因组研究的新纪元。铁皮石斛基因组精细图谱的完成，为云南省铁皮石斛行业标准制定奠定了基础，也为中国从基因水平分析和制定铁皮石斛标准提供了科学依据。铁皮石斛的基础研究和应用开发，必将进一步加快云南石斛产业的科学发展。
  普洱市人民政府对铁皮石斛基因组项目给予了大力支持，安排专项经费用于铁皮石斛全基因组测序研究。作为全国第一个支持基因组计划的地级市，充分表明了普洱生态立市、绿色发展的决心。
  据了解，铁皮石斛具有独特的药用价值，秦汉时期的《神农本草经》记载铁皮石斛“主伤中、除痹、下气、补五脏虚劳羸瘦、强阴、久服厚肠胃”；成书于一千多年前的道家医学经典《道藏》将铁皮石斛列为“中华九大仙草”之首；李时珍在《本草纲目》中评价铁皮石斛“强阴益精，厚肠胃，补内绝不足，平胃气，长肌肉，益智除惊，轻身延年”；民间称其为“救命仙草”。全球约有1400个石斛品种，主要分布于热带亚洲至大洋洲。在我国，石斛约有74个正种和2个亚种，分布于秦岭以南的各个省区，尤其以西南和台湾最多。云南省占到了54种，普洱市有37种。由于铁皮石斛对生长条件要求苛刻，人工种植难度很高，成为炙手可热的高端保健品。普洱利用其生物多样性和特殊的地理环境，正在建设全国特色生物产业聚集区。特别引进了康恩贝集团为龙头，大力发展生物药基地，建设全国最大的铁皮石斛基地。
  会上获悉，云南农业大学已经建立“中国药用植物基因组数据库”，向全世界提供中国科学家在中国传统中医药理论的最新研究成果。同时，云南农业大学将在未来3年内，以云南特色中药材为基础，开展系统的基础研究和应用开发，全面开展云南特色中药材基因组研究和开发，快速推进科研成果转化及产业化，着力打造独具特色的云南生物药业。
  中药现代化和国际化必需依靠科技创新来实现，基因组测序技术的进步为中药现代化提供了强大的科技支撑。该项目发起人、云南农业大学校长、普洱市副市长盛军教授指出，铁皮石斛基因组的完成，将会改变铁皮石斛产业凭经验发展的现状，为品种鉴定、基因育种、成分和功能研究以及新产品开发提供基础数据，将持续推动云南石斛产业的可持续发展。该项目的另一负责人王文研究员从基础研究层面充分肯定了铁皮石斛基因组的意义，他认为，铁皮石斛基因组将为兰科植物的起源、演化和特性研究提供最基础数据，作为第一个被解析的药食同用植物基因组，也将进一步提振中药的国际知名度，促进中草药的现代化。

人民网：云南完成铁皮石斛基因精细图谱 将有力推动全省石斛产业发展

http://yn.people.com.cn/original/n/2013/0904/c229982-19462119.html

香港文汇网：云南完成铁皮石斛基因精细图谱

http://yn.wenweipo.com/whshidian/ShowArticle.asp?ArticleID=48379

 

云南网：云南主导完成第一个植物基因组

http://puer.yunnan.cn/html/2013-09/04/content_2872442.htm